収穫を終えた土佐文旦は、野囲いで貯蔵されます。

板で囲い、ビニールやムロと呼ばれる敷物を敷き、再びビニールを被せ乾燥させた稲わらを乗せます。

採れたての文旦はまだ酸味が強いですが、こうすることにより実の熟成が進み、風味の良い美味しい文旦になります。

収穫を終えると、出荷と平行して来年度の花を咲かせるために文旦の樹の剪定作業が行われています。

そうして出荷が終わると、息をつく間もなく文旦の花が咲き始め、人工受粉作業が始まります。

土佐文旦は自家受粉が難しい為、必ず別の柑橘を用いて人工受粉作業を施します。

一般的には小夏（日向夏）の花粉で行われています。

この作業は土佐文旦の栽培の根幹を成すものですので、雨が降ると作業が出来ません。

この時期は毎日何度も天気予報を確認し、雨が降らないか不安な日々が続きます。

人工受粉作業を経て、土佐文旦の実がたくさん成り始めます。

最初は黄色ではなく緑色です。

このまま全ての実を成らしたいですが、樹が栄養不足になり自然に落果したり、小玉傾向になったり、厳しい乾燥や日照りが続くと樹そのものが枯死にしてしまう危険性もあります。

そのため6月〜10月の間に、3回程に分けて摘果作業を行います。

一度で落としきってしまうと、雨量等自然の影響を受けて実のサイズをコントロール出来なくなるので、こまめな作業が必要になります。